在程风的主导下，将他此前在自己麾下军马中所作的事情扩大到整个山寨。
即按照精干、强悍、机动的思路重整山寨军马，统一调配资源，整个军队建制以步军为主、马军为辅，马军又以重骑兵为主。
山东不比少华山，远离产马良地，建立骑兵尤其是重骑兵对马的质量要求极高。
为了把好钢用到刀刃上，集中力量办大事，不浪费呼延灼带来的三千副具装马甲，所以选择了发展重骑兵这条道路。而轻骑兵，自有少华山主建，将来两军合一，自然能形成合理搭配。
依照能力分层选拔精锐，一流好汉入重骑兵、二流好汉入轻骑兵、三流好汉入弩兵、枪兵、刀盾兵。
身体条件不入流的人，全部卸甲归田，采莲子、挖莲藕、捕鱼虾，山上不养一个闲汉。
出乎意料的是，程风对护卫梁山的水军似乎不太重视，特别是在船只建造方面下的功夫并不大。
对此他与阮氏三兄弟和李俊、张顺、张横有过一番深入交谈，令他们明白了程风的心思并不想打造一支内湖水军，他的目标是星辰大海，他想要的是一支远洋水军。
程风所虑之大之远令众人瞠目结舌，梁山泊的水面是如此之浩淼，他们从未想过将来要远离这里，甚至到海上作战。
而海船与湖船在构造上有很大不同，最简单来说，由于风浪大小不同、航道深浅不同，海船多尖底、湖船多平底，由此带来的水军战术也不同。
所以，程风不想把宝贵资源浪费在内湖水军建设上，但问到究竟如何及何时让他们驰骋在外洋，程风没有说得太明白，只是说时间不会太久，只是暂且委屈他们一下。
程风靠着与马政的关系，送了阮小五、阮小七和童威、童猛及十几名水军中的头目进入登州水军，化名入伍，学习水军战法。
经过整编调配、精兵强军，最终形成了三千重骑及辅兵三千，两千轻骑，轻重步军六千，水军一千，攻城器械军一千，总计一万六千人的精锐军马。
重骑兵及其辅兵由呼延灼统领，下设十二部，除了呼延灼自领一部外，其余十一部部将分别为：杨志、董平、孙立、史进、李应、穆弘、朱仝、韩滔、彭玘、欧鹏、周通。
轻骑兵由林冲统领，下设四部，除了林冲自领一部外，其余三部部将分别为：陈达、李云、邹渊。
步军由鲁智深统领，下设十二部，除了鲁智深自领一部外，其余十一部部将分别为：刘唐、樊瑞、解珍、解宝、项充、李衮、马麟、李忠、孙新、穆春、邹润。
水军由李俊统领，阮小二为副，阮小五、阮小七、张横、张顺、童威、童猛在其手下听命。
攻城器械军由凌振统领，曹正、陶宗旺为副。主要负责监造攻城器械、训练特殊攻城部队。
总探声息头领一员顾大嫂，军中走报机密头领朱富、施恩、白胜、乐和、王定六。
军师朱武，掌管钱粮头领两员柴进、蒋敬。行文走檄调兵遣将一员萧让。专造一应兵符印信一员金大坚。
军械监造头领汤隆。战船监造头领孟康。梁山军医院院长安道全。专造旌旗战袍头领侯健。
守护中军头领扈三娘，这个还是自己人最保险。专一把捧帅字旗一员郁保四。
东山、西山、北山、南山酒店负责头领，张青、孙二娘、杜兴、李立。
山寨后勤供应头领朱贵，杜迁、宋万为副，负责修葺房舍、安排宴席等诸多杂事。
程风这番安排，基本上考虑到每名头领的能力和特长，又确保了每支重要的军马都有自己的心腹掌握，还要平衡各派人马利益，照顾各方感受，也是颇费了些心思。
由于他是后世来的人，有些观念看起来比较超前，比如男尊女卑的思想要淡很多，破格选任顾大嫂为总探声息头领，这一安排令众人瞠目结舌。
对此程风看得很清楚，梁山三名女头领中，顾大嫂的实力被严重低估，特别是洞悉人心、杀伐果断的手段，处事又细致周密，这方面的能力远远超过大部分男头领。这样的人十分适合干情报特别是情报领导工作。
情报！第一重要的是情报！拥有现代观念的他对谍报力量非常重视，为顾大嫂安排了足足五名副手。而且，立即派施恩与乐和前往汴京，朱富、白胜前往雄州，王定六前往杭州设立了情报站点。
汴京是首都，其重要性不言而喻；雄州是北方军事重镇，将来宋辽金交战的前沿；杭州是南方经济中心，派王定六去主要是掌握方腊起事的动态。
一张情报大网撒下去，这样才能坐居山寨之中而知天下事，运筹帷幄、未雨绸缪。
程风对攻城器械颇为看重，特意组建了攻城器械军，人数虽然不太多，但独起一军，在同时代来说，也是独一份的特殊待遇。
凌振主攻投石车，陶宗旺主攻地道掘进。曹成为人老成、有脑子，居中协调谋划，也能起监视作用，毕竟他是林冲的徒弟，相对而言要牢靠一些。
将最头痛的人事问题解决后，程风便集中精力推动练军，此时他从种师道所学的青涧军兵法起到了关键作用。
经过数月训练，全军上下的旗帜、金鼓号令得以统一，令行禁止、号令必达，举止投足间更像一支正规官军。
程风现在接手的梁山后勤状况比当日接手的少华山要好多了，目前来看，依靠以前的积蓄和自身的生产能力，钱粮支撑个三年不成问题。
对朝廷的态度，程风现在是不接触、不对抗、不骚扰、不劫掠，有些头领见程风如此作为，担心坐吃山空，也在不同场合表达了自己的忧虑。
对此，程风总是洒然一笑，道：“只管使劲吃、使劲练军，钱财的事情自然包在我身上。”
那些人见他如此自信肯定，也就不再说什么了，因为眼前这位年轻人本事大家都是看在眼里的，两年间便从一百多人的小头目干成了梁山大寨主，跟着这等人干，还有什么好怀疑的呢？