我方最高谈判代表被害，进一步暴露了分裂主义分子,勾结列强，企图以武力阻止我军进军吐蕃，破坏吐蕃的和平解放的险恶目的。
在拒绝和平谈判的同时，吐蕃地方当局将其总兵力的2\/3，计7个代本全部和3个代本一部4500人，以及土兵(吐蕃的民间武装，归土司头人掌握)、僧兵3500人共8000余人，分布于昌都周围及金沙江以西地区，统归昌都边使总署总督指挥。
其具体部署是：
以第8代本全部、第7代本大部及第2、第6代本各一部和噶伦卫队集结于昌都；
以第7代本之另一部位于类乌齐；
以第3代本和真伯啦代本位于生达地区；
以第10代本位于江达地区；
以第9代本位于宁静、盐井地区；
以第4代本位于丁青地区；
其余300名土僧兵配属各代本分散配置于上述地区。
从敌防御部署来看，对方就是缺乏作战经验的。
在防御上没有留下足够的预备队。
吐蕃全体官兵除了几百人留守昌都之外，其余军队都被分散布防于边境沿线;面对如此单薄的防线，我军随时都可能突破，而边防军后面并没有设置第二道防线。
随着9月底的到来，许多人都推测冬季的临近意味着内地军队可能不会发动进攻，从而使缺乏实战经验的吐蕃逐渐放松了警惕。
而考虑到昌都是吐蕃东部的政治、经济中心，是我军进藏的咽喉要道、为了打通解放雪域高原的道路，西南军区决心集中6个团2万余人的兵力发起昌都战役。
战役的目的，是歼灭吐蕃军有生力量，促成和平进军吐蕃。
我军分析后认为，吐蕃军在我军进攻之下，有可能扼守若干要点进行抵抗，或分散各地打游击，或以主力分路撤退，而撤退将经过恩达、类乌齐地区。
因此刘子龙要求参战部队在兵力部署上，以主力实行两翼迂回，断其退路，将吐蕃军主力歼火于昌都及其以西的恩达、类乌齐地区。
与此同时，对吐蕃军特别是土兵，要大力开展争取工作。
与吐蕃方面的举棋不定、临阵换将、布置失当相比，我军则布置十分周密。
第18军决心将参战部队分为南、北集团，并将主力使用于北线，具体部署是：
北线集团由第18军第52师、军炮兵、侦察、工兵营，第54师炮兵连及西北军区青省骑兵支队组成，由第52师统一指挥，分为左、中、右三路；
右路为第52师骑兵连、侦察连、炮兵连、第154团、青省骑兵支队。
其中，第154团由邓柯偷渡金沙江，会同由玉树南下的青省骑兵支队，直插类乌齐、恩达，切断吐蕃军退路，并准备阻止丁青藏军东援，青省骑兵支队一部直插昌都以南，阻止吐蕃军南窜；
中路为第52师师直、第155团、第156团及军炮兵营，由邓柯隐蔽渡江，经生达等地直捣昌都；
左路为军侦察营、工兵营及第54师炮兵连，由德格渡江，歼灭同普、江达之吐蕃军，配合中路主力从正面攻击昌都，并以一部迂回昌都以南，歼灭可能南逃之吐蕃军。
南线集团由第18军第53师第157团、炮兵连、工兵连及第14军第42师第126团（欠一个营）、第125团第3营组成，由第53师统一指挥，分为左、右两路。
右路第157团，由巴塘渡江，围歼宁静地区之吐蕃军队，主力出邦达、八宿，切断吐蕃军队南退之路；
左路第42师所部，由贡山、德钦出动，歼灭盐井、门工、碧土地区的吐蕃军队，而后向西北方向佯动。
9月13日，18军发出昌都战役指导命令，要求部队恪守政策纪律，团结吐蕃人民，发扬吃大苦耐大劳精神，严格节约粮食，保证\"战役在军事上政治上的全胜\"，\"为吐蕃人民立下第一功\"。
而双方的军事冲突，早在七月份便开始了。
七月，双方在昌都东北部约160公里处的一个村落邓柯发生了第一次军事接触。
邓柯地处甘孜至玉树的交通要道旁，昌都总管在该地区设置了一座无线电台。
我军发动突然袭击，一举捣毁了这座电台。
据逃回昌都的话务员描述:\"我在无线电收发站内向窗外观看……他们已到了这里，有好几百人，他们一齐涌进电台的院子里。我告诉了在电台旁的索朗平措，可是他仍然继续发报，因而遭逮捕。他们已经在途中抓住了索朗多吉，我躲藏在一个食品柜里，他们始终没有打开看过。当晚我就爬出来逃走了。\"
事后，吐蕃军调集一支精锐部队，计划向玉树的我军发起反击，解救报务员，夺回电台，并且对我军备战给予沉重打击。
他认为我军初来乍到，对康区的百姓不了解，又不熟悉地形，这是发动突然袭击最佳时机。
然而，事情并没有按照对方的计划发展。邓柯地区的当地人欺骗了吐蕃军队，并没有把我军的确切方位告诉对方，使对方的部队中了我军的埋伏而伤亡惨重。
这次小规模的作战，摧毁了对方的电台后，麻痹大意的吐蕃军队竟然没有及时将电台补充回来，这给我军下一步作战进一步提供了方便。
10月6日，各部队按照预定作战计划，发起昌都战役。
北线集团右路之第154团，6日由邓柯西渡金沙江后，向北绕道玉树巴塘之后，跟随青省骑兵支队南下。
部队绕过当面吐蕃军队，穿越草原，以强行军直插昌都以西。
18日，骑兵支队先吐蕃军数小时抢占恩达，第154 团攻占类乌齐。
19日，骑兵支队主力及第154团一部向昌都以南机动。
至此，昌都地区吐蕃军队西逃的道路被完全切断。
担任向昌都正面攻击之北集团左路部队，于7日渡江，向岗托吐蕃军攻击。
吐蕃军稍加抵抗即会同江达等地的吐蕃军向昌都撤逃。
部队即行猛追，16日在觉雍以西歼灭吐蕃军百余人，19日黄昏迫近昌都。